В 2021 году открыт филиал в г. Москва, который осуществляет деятельность на территории следующих субъектов РФ: г. Москва, Московская область, Белгородская область, Владимирская область, Ивановская область, Калужская область, Костромская область, Курская область, Орловская область, Нижегородская область, Рязанская область, Брянская область, Смоленская область, Тверская область, Тульская область, Вологодская область, Ярославская область.
Руководитель Филиала в г. Москва - вице-президент ООО "Азово-Черноморский научный центр рыбохозяйственных исследований" , кандидат биологических наук Денисенко Олег Сергеевич.
Адрес филиала: 119313, г. Москва, Ленинский проспект д.95 Б
Услуги филиала полностью идентичны основному подразделению